Биоинформационный анализ данных (программное обеспечение и интернет-ресурсы): NCBI — Национальный центр биотехнологической информации занимается продвижением вопросов науки и здоровья благодаря доступу к биомедицинской и геномной информации (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/). Genome – ресурс, обеспечивающий информацией о геномах, их последовательностях, картировании, хромосомах и аннотации (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/browse/). BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) – инструментарий для поиска регионов локального сходства между последовательностями. Программа сравнивает нуклеотидные и аминокислотные последовательности с последовательностями соответствующих баз данных и вычисляет значение статистически значимого сходства. BLAST может быть использован для заключений функциональных и эволюционных взаимоотношений между последовательностями, так же как и помогает идентифицировать представителя генных семейств (http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi). Gene  — база данных представляет собой информацию о генах из широкого круга видов организмов, включающую номенклатуру, референсные последовательности (RefSeqs), картирование, биохимические пути, генные вариации, фенотипы и ссылки на геномные, фенотипические и локус-специфичные всемирные ресурсы (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene). Nucleotide — база данных представляет собой коллекцию последовательностей из нескольких источников, включающих GenBank, RefSeq, TPA и PDB (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore). Taxonomy – база данных, включающая вопросы классификации и номенклатуры всех живых организмов, в настоящее время представляющих около 10% из описанных видов, живущих на планете (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/taxonomy). PubMed – ресурс, включающий более 22 миллионов ссылок на биомедицинскую литературу из MEDLINE, журналов науки о жизни и online книг. Цитаты могут включать ссылки на полнотекстовое содержание из PubMed Central или на  web-сайты издательств (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/). In silico simulation of molecular biology experiments – интернет-ресурс, позволяющий проводить виртуальные эксперименты с полными геномами, а также с нуклеотидными последовательностями   (http://insilico.ehu.es/) (Bikandi et al., 2004). The mfold Web Server — интернет-ресурс, позволяющий проводить вычисление нескольких вероятностных вторичных структур нуклеотидной последовательности с характеризующими её параметрами (http://mfold.rna.albany.edu/?q=mfold/dna-folding-form). CMR (The Comprehensive Microbial Resource) – свободный web-сайт для предоставления информации обо всех полностью секвенированных прокариотических геномах. Помимо удобного доступа ко всем организмам на одном сайте, в CMR возможен удобный многофункциональный поиск и перекрёстный анализ различий и сходств между геномами (http://cmr.jcvi.org/tigr-scripts/CMR/CmrHomePage.cgi). Доступ к полностью секвенированным бактериям и геномному инструментарию, в частности проведение виртуального рестрикционного анализа нуклеотидных последовательностей и многое другое (Peterson et al., 2001). LPSN (List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature) — современный перечень названий прокариот согласно номенклатуре (http://www.bacterio.cict.fr/index.html). ICSPSubcommittee on the taxonomy of Rhizobium and Agrobacterium – этот сайт посвящен различным вопросам, связанным с молекулярной систематикой, таксономией, геномикой, экологией и эволюцией симбиотических бобовых клубеньковыми бактериями, которые все вместе известны как «ризобии». К тому же, сайт предоставляет практические руководства по различным вопросам филогенетического анализа последовательностей данных и много другой ценной информации, такой как ссылки на предстоящие научные конференции, на ключевые документы в вышеупомянутых областях и т.д. (http://edzna.ccg.unam.mx/rhizobial-taxonomy/). На данном сайте можно найти: 1) современную информацию о таксономии всех утверждённых и ожидаемых ризобиальных/агробактериальных таксонах; 2) практические руководства о том, как выполнить филогенетический анализ, используя последовательности данных, элаймент последовательностей 16S рРНК и модельное выравнивание, вплоть до построения ML-деревьев; 3) информацию по актуальным вопросам ризобиальной таксономии, систематики и геномики, в том числе о научных совещаниях и семинарах; 4) практические советы и рекомендации Подкомитета для микробиологов в области таксономии и систематики. IMG (Integrated Microbial Genomes) – этот сайт представляет собой общественный ресурс для анализа и аннотации геномных и метагеномных данных в комплексном сравнительном контексте. IMG хранилище данных совмещает в себе общедоступную информацию о геномах и метагеномах (https://img.jgi.doe.gov/cgi-bin/m/main.cgi). The Xanthomonas Resourse — полезные ссылки на литературу и конференции (http://www.xanthomonas.org/meetings.html). «Биомолекула» — это научно-популярный сайт, посвящённый молекулярным основам современной биологии и практическим применениям научных достижений в медицине и биотехнологии.  Сайт публикует новости молекулярной биологии, вдумчивые обстоятельные обзоры и переводы философских эссе на научные темы (http://biomolecula.ru/).